Evaluating QM/MM Free Energy Surfaces for Ranking Cysteine Protease Covalent Inhibitors. - Clauber Henrique Costa; Vinícius Bonatto; Alberto M. dos Santos; Jerônimo Lameira; Andrei Leitão; Carlos Alberto Montanari (J. Chem. Inf. Model., 2020)

Assessment of Reversibility for Covalent Cysteine Protease Inhibitors Using Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Free Energy Surfaces. - Alberto M. dos Santos; Amanda Ruslana Santana Oliveira; Clauber Henrique Costa; Peter W. Kenny; Carlos Alberto Montanari; Jaldyr de Jesus G. Varela; Jerônimo Lameira (J. Chem. Inf. Model., 2022)

Conformational Dynamics and Binding Interactions of SARS-CoV-2 Spike Protein Variants: Omicron, XBB.1.9.2, and EG.5. - Clauber Henrique Costa; Camila Auad Beltrão de Freitas; Alberto M. dos Santos; Carlos Gabriel da Silva de Souza; José Rogério A. Silva; Jerônimo Lameira; Vicent Moliner; Munir S. Skaf (J. Chem. Inf. Model., 2025)