Protein-Struktur und Funktion: Die Mölichkeiten und Probleme der Computersimulation aus der Sicht des Experimentators. - Andreas Plückthun; Jutta Köhler (Forum Wissenschaft und Technik, 1990)

Docking small ligands in flexible binding sites. - Joannis Apostolakis; Andreas Plückthun; Amedeo Caflisch (J. Comput. Chem., 1998)

Assessment of ab initio models of protein complexes by molecular dynamics. - Filip Radom; Andreas Plückthun; Emanuele Paci (PLoS Comput. Biol., 2018)