Centrality Speeds the Subgraph Isomorphism Search Up in Target Aware Contexts. - Vincenzo Bonnici; Simone Caligola; Antonino Aparo; Rosalba Giugno (CIBB, 2018)

Simple Pattern-only Heuristics Lead to Fast Subgraph Matching Strategies on Very Large Networks. - Antonino Aparo; Vincenzo Bonnici; Giovanni Micale; Alfredo Ferro; Dennis E. Shasha; Alfredo Pulvirenti; Rosalba Giugno (PACBB, 2018)

TEDAR: Temporal dynamic signal detection of adverse reactions. - Antonino Aparo; Pietro Sala; Vincenzo Bonnici; Rosalba Giugno (Artif. Intell. Medicine, 2021)

DiGAS: Differential gene allele spectrum as a descriptor in genetic studies. - Antonino Aparo; Vincenzo Bonnici; Simone Avesani; Luciano Cascione; Rosalba Giugno (Comput. Biol. Medicine, 2024)

Identifying the joint signature of brain atrophy and gene variant scores in Alzheimer's Disease. - Federica Cruciani; Antonino Aparo; Lorenza Brusini; Carlo Combi; Silvia Francesca Storti; Rosalba Giugno; Gloria Menegaz; Ilaria Boscolo Galazzo (J. Biomed. Informatics, 2024)

EasyCircR: Detection and reconstruction of circular RNAs post-transcriptional regulatory interaction networks. - Antonino Aparo; Simone Avesani; Luca Parmigiani; Sara Napoli; Francesco Bertoni; Vincenzo Bonnici; Luciano Cascione; Rosalba Giugno (Comput. Biol. Medicine, 2025)