Systems medicine of inflammaging. - Gastone C. Castellani; Giulia Menichetti; Paolo Garagnani; Maria Giulia Bacalini; Chiara Pirazzini; Claudio Franceschi; Sebastiano Collino; Claudia Sala; Daniel Remondini; Enrico Giampieri; Ettore Mosca; Matteo Bersanelli; et al. (Briefings Bioinform., 2016)

Methods for the integration of multi-omics data: mathematical aspects. - Matteo Bersanelli; Ettore Mosca; Daniel Remondini; Enrico Giampieri; Claudia Sala; Gastone C. Castellani; Luciano Milanesi (BMC Bioinform., 2016)

Stochastic neutral modelling of the Gut Microbiota's relative species abundance from next generation sequencing data. - Claudia Sala; Silvia Vitali; Enrico Giampieri; Ìtalo Faria do Valle; Daniel Remondini; Paolo Garagnani; Matteo Bersanelli; Ettore Mosca; Luciano Milanesi; Gastone C. Castellani (BMC Bioinform., 2016)

Missing value estimation methods for DNA methylation data. - Pietro Di Lena; Claudia Sala; Andrea Prodi; Christine Nardini (Bioinform., 2019)

Methylation data imputation performances under different representations and missingness patterns. - Pietro Di Lena; Claudia Sala; Andrea Prodi; Christine Nardini (BMC Bioinform., 2020)

Impact of concurrency on the performance of a whole exome sequencing pipeline. - Daniele Dall'Olio; Nico Curti; Eugenio Fonzi; Claudia Sala; Daniel Remondini; Gastone C. Castellani; Enrico Giampieri (BMC Bioinform., 2021)

Correction to: Impact of concurrency on the performance of a whole exome sequencing pipeline. - Daniele Dall'Olio; Nico Curti; Eugenio Fonzi; Claudia Sala; Daniel Remondini; Gastone C. Castellani; Enrico Giampieri (BMC Bioinform., 2021)

Estimage: a webserver hub for the computation of methylation age. - Pietro Di Lena; Claudia Sala; Christine Nardini (Nucleic Acids Res., 2021)

Evaluation of different computational methods for DNA methylation-based biological age. - Pietro Di Lena; Claudia Sala; Christine Nardini (Briefings Bioinform., 2022)

Survival Model Optimization via Federated Learning: A Study Combining Simulations and Experiments. - Francesco Casadei; Luciana Carota; Gianluca Asti; Saverio D'Amico; Davide Piscia; Santiago Zazo; Patricia A. Apellániz; Juan Parras; Claudia Sala; Cesare Rollo; Nono S. C. Merleau; Piero Fariselli; et al. (IEEE Big Data, 2024)

Deep Learning for Classifying Anti-Shigella Opsono- Phagocytosis-Promoting Monoclonal Antibodies. - Elena Pianfetti; Dario Cardamone; Emanuele Roscioli; Giorgio Ciano; Giuseppe Maccari; Claudia Sala; Francesca Micoli; Rino Rappuoli; Duccio Medini; Elisa Ficarra (MOVI@MICCAI, 2024)

Where are we in the implementation of tissue-specific epigenetic clocks? - Claudia Sala; Pietro Di Lena; Danielle Fernandes Durso; Ìtalo Faria do Valle; Maria Giulia Bacalini; Daniele Dall'Olio; Claudio Franceschi; Gastone C. Castellani; Paolo Garagnani; Christine Nardini (Frontiers Bioinform., 2024)

Covering Hierarchical Dirichlet Mixture Models on binary data to enhance genomic stratifications in onco-hematology. - Daniele Dall'Olio; J. Eric Sträng; Amin T. Turki; Jesse M. Tettero; Martje Barbus; Renate Schulze-Rath; Javier Martinez Elicegui; Tommaso Matteuzzi; Alessandra Merlotti; Luciana Carota; Claudia Sala; Matteo G. Della Porta; et al. (PLoS Comput. Biol., 2024)

Artificial Intelligence model to predict resistances in Gram-negative bloodstream infections. - Cecilia Bonazzetti; Ettore Rocchi; Alice Toschi; Nicolas Riccardo Derus; Claudia Sala; Renato Pascale; Matteo Rinaldi; Caterina Campoli; Zeno Adrien Igor Pasquini; Beatrice Tazza; Armando Amicucci; Milo Gatti; et al. (npj Digit. Medicine, 2025)