PASS: a program to align short sequences. - Davide Campagna; Alessandro Albiero; Alessandra Bilardi; Elisa Caniato; Claudio Forcato; Svetlin Manavski; Nicola Vitulo; Giorgio Valle (Bioinform., 2009)

PASS-bis: a bisulfite aligner suitable for whole methylome analysis of Illumina and SOLiD reads. - Davide Campagna; Andrea Telatin; Claudio Forcato; Nicola Vitulo; Giorgio Valle (Bioinform., 2013)

QueryOR: a comprehensive web platform for genetic variant analysis and prioritization. - Loris Bertoldi; Claudio Forcato; Nicola Vitulo; Giovanni Birolo; Fabio De Pascale; Erika Feltrin; Riccardo Schiavon; Franca Anglani; Susanna Negrisolo; Alessandra Zanetti; Francesca D'Avanzo; Rosella Tomanin; et al. (BMC Bioinform., 2017)