pdbFun: mass selection and fast comparison of annotated PDB residues. - Gabriele Ausiello; Andreas Zanzoni; Daniele Peluso; Allegra Via; Manuela Helmer-Citterich (Nucleic Acids Res., 2005)

Local comparison of protein structures highlights cases of convergent evolution in analogous functional sites. - Gabriele Ausiello; Daniele Peluso; Allegra Via; Manuela Helmer-Citterich (BMC Bioinform., 2007)

SH3-Hunter: discovery of SH3 domain interaction sites in proteins. - Enrico Ferraro; Daniele Peluso; Allegra Via; Gabriele Ausiello; Manuela Helmer-Citterich (Nucleic Acids Res., 2007)

3dLOGO: a web server for the identification, analysis and use of conserved protein substructures. - Allegra Via; Daniele Peluso; Pier Federico Gherardini; Emanuele de Rinaldis; Teresa Colombo; Gabriele Ausiello; Manuela Helmer-Citterich (Nucleic Acids Res., 2007)

VirusMINT: a viral protein interaction database. - Andrew Chatr-aryamontri; Arnaud Céol; Daniele Peluso; Aurelio Nardozza; Simona Panni; Francesca Sacco; Michele Tinti; Alex Smolyar; Luisa Castagnoli; Marc Vidal; Michael E. Cusick; Gianni Cesareni (Nucleic Acids Res., 2009)

MINT, the molecular interaction database: 2009 update. - Arnaud Céol; Andrew Chatr-aryamontri; Luana Licata; Daniele Peluso; Leonardo Briganti; Livia Perfetto; Luisa Castagnoli; Gianni Cesareni (Nucleic Acids Res., 2010)

MINT, the molecular interaction database: 2012 update. - Luana Licata; Leonardo Briganti; Daniele Peluso; Livia Perfetto; Marta Iannuccelli; Eugenia Galeota; Francesca Sacco; Anita Palma; Aurelio Nardozza; Elena Santonico; Luisa Castagnoli; Gianni Cesareni (Nucleic Acids Res., 2012)

The MIntAct project - IntAct as a common curation platform for 11 molecular interaction databases. - Sandra E. Orchard; Mais G. Ammari; Bruno Aranda; Lionel Breuza; Leonardo Briganti; Fiona Broackes-Carter; Nancy H. Campbell; Gayatri Chavali; Carol Chen; Noemi del-Toro; Margaret J. Duesbury; Marine Dumousseau; et al. (Nucleic Acids Res., 2014)

SIGNOR: a database of causal relationships between biological entities. - Livia Perfetto; Leonardo Briganti; Alberto Calderone; Andrea Cerquone Perpetuini; Marta Iannuccelli; Francesca Langone; Luana Licata; Milica Marinkovic; Anna Mattioni; Theodora Pavlidou; Daniele Peluso; Lucia Lisa Petrilli; et al. (Nucleic Acids Res., 2016)

DISNOR: a disease network open resource. - Prisca Lo Surdo; Alberto Calderone; Marta Iannuccelli; Luana Licata; Daniele Peluso; Luisa Castagnoli; Gianni Cesareni; Livia Perfetto (Nucleic Acids Res., 2018)

SIGNOR 2.0, the SIGnaling Network Open Resource 2.0: 2019 update. - Luana Licata; Prisca Lo Surdo; Marta Iannuccelli; Alessandro Palma; Elisa Micarelli; Livia Perfetto; Daniele Peluso; Alberto Calderone; Luisa Castagnoli; Gianni Cesareni (Nucleic Acids Res., 2020)