Visual Exploration of Genetic Sequence Variants in Pangenomes. - Astrid van den Brandt; Eef M. Jonkheer; Dirk-Jan M. van Workum; Sandra Smit; Anna Vilanova (EuroVis (Posters), 2022)

PanTools v3: functional annotation, classification and phylogenomics. - Eef M. Jonkheer; Dirk-Jan M. van Workum; Siavash Sheikhizadeh Anari; Balázs Brankovics; Jorn R. de Haan; Lidija Berke; Theo A. J. van der Lee; Dick de Ridder; Sandra Smit (Bioinform., 2022)

PanVA: Pangenomic Variant Analysis. - Astrid van den Brandt; Eef M. Jonkheer; Dirk-Jan M. van Workum; Huub van de Wetering; Sandra Smit; Anna Vilanova (IEEE Trans. Vis. Comput. Graph., 2024)