Efficient RNA isoform identification and quantification from RNA-Seq data with network flows. - Elsa Bernard; Laurent Jacob; Julien Mairal; Jean-Philippe Vert (Bioinform., 2014)

A convex formulation for joint RNA isoform detection and quantification from multiple RNA-seq samples. - Elsa Bernard; Laurent Jacob; Julien Mairal; Eric Viara; Jean-Philippe Vert (BMC Bioinform., 2015)

Deciphering splicing with sparse regression techniques in the era of high-throughput RNA sequencing. (Etude de l'épissage grâce à des techniques de régression parcimonieuse dans l'ère du séquençage haut débit de l'ARN). - Elsa Bernard (2016)