Fast alignment of mass spectra in large proteomics datasets, capturing dissimilarities arising from multiple complex modifications of peptides. - Grégoire Prunier; Mehdi Cherkaoui; Albane Lysiak; Olivier Langella; Mélisande Blein-Nicolas; Virginie Lollier; Emile Benoist; Géraldine Jean; Guillaume Fertin; Hélène Rogniaux; Dominique Tessier (BMC Bioinform., 2023)

Aspects algorithmiques de l'identification de peptides et de l'inférence de protéines par spectrométrie de masse. (Algorithmic aspects of peptide identification and protein inference by mass spectrometry). - Emile Benoist (2024)

The Exact Subset MultiCover problem. - Emile Benoist; Guillaume Fertin; Géraldine Jean (Theor. Comput. Sci., 2025)