"Molecular Anatomy": a new multi-dimensional hierarchical scaffold analysis tool. - Candida Manelfi; Marica Gemei; Carmine Talarico; Carmen Cerchia; Anna Fava; Filippo Lunghini; Andrea Rosario Beccari (J. Cheminformatics, 2021)

GENEOnet: A new machine learning paradigm based on Group Equivariant Non-Expansive Operators. An application to protein pocket detection. - Giovanni Bocchi; Patrizio Frosini; Alessandra Micheletti; Alessandro Pedretti; Carmen Gratteri; Filippo Lunghini; Andrea Rosario Beccari; Carmine Talarico (CoRR, 2022)

Tunable and Portable Extreme-Scale Drug Discovery Platform at Exascale: the LIGATE Approach. - Gianluca Palermo; Gianmarco Accordi; Davide Gadioli; Emanuele Vitali; Cristina Silvano; Bruno Guindani; Danilo Ardagna; Andrea Rosario Beccari; Domenico Bonanni; Carmine Talarico; Filippo Lunghini; Jan Martinovic; et al. (CF, 2023)

ProfhEX: AI-based platform for small molecules liability profiling. - Filippo Lunghini; Anna Fava; Vincenzo Pisapia; Francesco Sacco; Daniela Iaconis; Andrea Rosario Beccari (J. Cheminformatics, 2023)

LIGATE - LIgand Generator and portable drug discovery platform AT Exascale. - Gianluca Palermo; Gianmarco Accordi; Davide Gadioli; Yuedong Zhang; Emanuele Vitali; Bruno Guindani; Danilo Ardagna; Cristina Silvano; Andrea Rosario Beccari; Domenico Bonanni; Carmine Talarico; Filippo Lunghini; et al. (CF (Companion), 2024)

A geometric XAI approach to protein pocket detection. - Giovanni Bocchi; Patrizio Frosini; Alessandra Micheletti; Alessandro Pedretti; Gianluca Palermo; Davide Gadioli; Carmen Gratteri; Filippo Lunghini; Andrea Rosario Beccari; Anna Fava; Carmine Talarico (xAI (Late-breaking Work, Demos, Doctoral Consortium), 2024)

"DompeKeys": a set of novel substructure-based descriptors for efficient chemical space mapping, development and structural interpretation of machine learning models, and indexing of large databases. - Candida Manelfi; Valerio Tazzari; Filippo Lunghini; Carmen Cerchia; Anna Fava; Alessandro Pedretti; Pieter F. W. Stouten; Giulio Vistoli; Andrea Rosario Beccari (J. Cheminformatics, 2024)

GENEOnet: Statistical analysis supporting explainability and trustworthiness. - Giovanni Bocchi; Patrizio Frosini; Alessandra Micheletti; Alessandro Pedretti; Carmen Gratteri; Filippo Lunghini; Andrea Rosario Beccari; Carmine Talarico (CoRR, 2025)