HolomiRA: a reproducible pipeline for miRNA binding site prediction in microbial genomes. - Jennifer Jessica Bruscadin; Tainã Figueiredo Cardoso; Liliane Costa Conteville; Juliana Virginio da Silva; Adriana Mércia Guaratini Ibelli; Gabriel Alexander Colmenarez Pena; Thanny Porto; Priscila Silva Neubern de Oliveira; Bruno Gabriel Nascimento Andrade; Adhemar Zerlotini; Luciana Correia de Almeida Regitano (BMC Bioinform., 2025)