Inférence de réseaux de régulation de gènes au travers de scores étendus dans les réseaux bayésiens. - Jimmy Vandel; Brigitte Mangin; Matthieu Vignes; Damien Leroux; Olivier Loudet; Marie-Laure Martin-Magniette; Simon de Givry (Rev. d'Intelligence Artif., 2012)

Apprentissage de la structure de réseaux bayésiens. Application aux données de génétique-génomique. - Jimmy Vandel (2012)

SAGA: sparse and geometry-aware non-negative matrix factorization through non-linear local embedding. - Nicolas Courty; Xing Gong; Jimmy Vandel; Thomas Burger (Mach. Learn., 2014)

Probing instructions for expression regulation in gene nucleotide compositions. - Chloé Bessière; May Taha; Florent Petitprez; Jimmy Vandel; Jean-Michel Marin; Laurent Bréhélin; Sophie Lèbre; Charles-Henri Lecellier (PLoS Comput. Biol., 2018)