Exploring fragment spaces under multiple physicochemical constraints. - Juri Pärn; Jörg Degen; Matthias Rarey (J. Comput. Aided Mol. Des., 2007)

Second-generation de novo design: a view from a medicinal chemist perspective. - Andrea Zaliani; Krisztina Boda; Thomas Seidel; Achim Herwig; Christof H. Schwab; Johann Gasteiger; Holger Claussen 002; Christian Lemmen; Jörg Degen; Juri Pärn; Matthias Rarey (J. Comput. Aided Mol. Des., 2009)

Entwicklung eines strukturbasierten de-novo-Design-Verfahrens und chemischer Fragmenträume für den rationalen Wirkstoffentwurf - Jörg Degen (2009)

Putting the available chemical space to the fingertips of our scientists. - Jörg Degen; Mark Rogers-Evans; Daniel Stoffler (J. Cheminformatics, 2012)