ModeRNA server: an online tool for modeling RNA 3D structures. - Magdalena Rother; Kaja Milanowska; Tomasz Puton; Jaroslaw Jeleniewicz; Kristian Rother; Janusz M. Bujnicki (Bioinform., 2011)

REPAIRtoire - a database of DNA repair pathways. - Kaja Milanowska; Joanna Krwawicz; Grzegorz Papaj; Jan Kosinski; Katarzyna Poleszak; Justyna Lesiak; Ewelina Osinska; Kristian Rother; Janusz M. Bujnicki (Nucleic Acids Res., 2011)

MetalionRNA: computational predictor of metal-binding sites in RNA structures. - Anna Philips; Kaja Milanowska; Grzegorz Lach; Michal J. Boniecki; Kristian Rother; Janusz M. Bujnicki (Bioinform., 2012)

MODOMICS: a database of RNA modification pathways - 2013 update. - Magdalena A. Machnicka; Kaja Milanowska; Okan Osman Oglou; Elzbieta Purta; Malgorzata Kurkowska; Anna Olchowik; Witold Januszewski; Sebastian Kalinowski; Stanislaw Dunin-Horkawicz; Kristian Rother; Mark Helm; Janusz M. Bujnicki; et al. (Nucleic Acids Res., 2013)

RNApathwaysDB - a database of RNA maturation and decay pathways. - Kaja Milanowska; Katarzyna Mikolajczak; Anna Lukasik; Marcin Skorupski; Zuzanna Balcer; Magdalena A. Machnicka; Martyna Nowacka; Kristian Rother; Janusz M. Bujnicki (Nucleic Acids Res., 2013)