How to compute protein residue contacts more accurately? - Pedro M. Martins 001; Vinícius D. Mayrink; Sabrina de Azevedo Silveira; Carlos Henrique da Silveira; Leonardo H. F. de Lima; Raquel Cardoso de Melo Minardi (SAC, 2018)

Propedia: a database for protein-peptide identification based on a hybrid clustering algorithm. - Pedro M. Martins 001; Lucianna Helene Santos; Diego C. B. Mariano; Felippe C. Queiroz; Luana L. Bastos; Isabela de Souza Gomes; Pedro H. C. Fischer; Rafael E. O. Rocha; Sabrina de Azevedo Silveira; Leonardo H. F. de Lima; Mariana T. Q. de Magalhães; Maria G. A. Oliveira; et al. (BMC Bioinform., 2021)

VTR: A Web Tool for Identifying Analogous Contacts on Protein Structures and Their Complexes. - Vitor Pimentel; Diego C. B. Mariano; Letícia Xavier Silva Cantão; Luana Luiza Bastos; Pedro H. C. Fischer; Leonardo Henrique Franca de Lima; Alexandre Victor Fassio; Raquel Cardoso de Melo Minardi (Frontiers Bioinform., 2021)