Random walk informed community detection reveals heterogeneities in large networks. - Solène Song; Malek Senoussi; Paul Escande; Paul Villoutreix (CoRR, 2022)

Random walk informed heterogeneity detection reveals how the lymph node conduit network influences T cells collective exploration behavior. - Solène Song; Malek Senoussi; Paul Escande; Paul Villoutreix (PLoS Comput. Biol., 2023)

Hierarchical novel class discovery for single-cell transcriptomic profiles. - Malek Senoussi; Thierry Artières; Paul Villoutreix (CoRR, 2024)

Partial label learning for automated classification of single-cell transcriptomic profiles. - Malek Senoussi; Thierry Artières; Paul Villoutreix (PLoS Comput. Biol., 2024)

Classification methods for single cell RNA sequencing data.: Learning with partial annotation and without supervision. (Méthodes de classification pour les données de séquençage de l'ARN à l'échelle de la cellule unique. / Méthodes de classification pour les données de séquençage de l'ARN à l'échelle de la cellule unique.: Apprentissage avec supervision partielle et sans supervision). - Malek Senoussi (2024)