The medical imaging interaction toolkit (MITK): a toolkit facilitating the creation of interactive software by extending VTK and ITK. - Ivo Wolf; Marcus Vetter; Ingmar Wegner; Marco Nolden; Thomas Böttger; Mark Hastenteufel; Max Schöbinger; Tobias Kunert; Hans-Peter Meinzer (Image-Guided Procedures, 2004)

The Medical Imaging Interaction Toolkit. - Ivo Wolf; Marcus Vetter; Ingmar Wegner; Thomas Böttger; Marco Nolden; Max Schöbinger; Mark Hastenteufel; Tobias Kunert; Hans-Peter Meinzer (Medical Image Anal., 2005)

MITK als telekonferenzfähiges PlugIn in der CHILI-Workstation. - Michael Hasselberg; Ivo Wolf; Marco Nolden; Mathias Seitel; Hans-Peter Meinzer; Uwe Engelmann (Bildverarbeitung für die Medizin, 2007)

Qualitätszentrierte Softwareentwicklung in wissenschaftlichen Arbeitsgruppen Auf dem Weg vom Prototypen zum Produkt. - Daniel Maleike; Jochen Neuhaus; Tobias Heimann; Marco Nolden; Jens Poxleitner; Max Schöbinger; Tina Schwarz; Mathias Seitel; Ingmar Wegner; Philipp Wolber; Hans-Peter Meinzer; Ivo Wolf (Bildverarbeitung für die Medizin, 2008)

MITK-IGT: Eine Navigationskomponente für das Medical Imaging Interaction Toolkit. - Jochen Neuhaus; Ingmar Wegner; Johannes Käst; Matthias Baumhauer; Alexander Seitel; Ingmar Gergel; Marco Nolden; Daniel Maleike; Ivo Wolf; Hans-Peter Meinzer; Lena Maier-Hein (Bildverarbeitung für die Medizin, 2009)

Interactive segmentation framework of the Medical Imaging Interaction Toolkit. - Daniel Maleike; Marco Nolden; Hans-Peter Meinzer; Ivo Wolf (Comput. Methods Programs Biomed., 2009)

Integrating the visualization concept of the medical imaging interaction toolkit (MITK) into the XIP-Builder visual programming environment. - Ivo Wolf; Marco Nolden; Tobias Schwarz; Hans-Peter Meinzer (Image-Guided Procedures, 2010)

The extensible open-source rigid and affine image registration module of the Medical Imaging Interaction Toolkit (MITK). - Daniel Stein; Klaus H. Fritzsche; Marco Nolden; Hans-Peter Meinzer; Ivo Wolf (Comput. Methods Programs Biomed., 2010)

Simplified development of image-guided therapy software with MITK-IGT. - Alfred M. Franz; Alexander Seitel; Mark Servatius; C. Zöllner; Ingmar Gergel; Ingmar Wegner; Jochen Neuhaus; Sascha Zelzer; Marco Nolden; Johannes Gaa; P. Mercea; Kwong Yung; et al. (Image-Guided Procedures, 2012)

MITK-ToF - Range data within MITK. - Alexander Seitel; Kwong Yung; Sven Mersmann; Thomas Kilgus; Anja Groch; Thiago R. dos Santos; Alfred M. Franz; Marco Nolden; Hans-Peter Meinzer; Lena Maier-Hein (Int. J. Comput. Assist. Radiol. Surg., 2012)

The Medical Imaging Interaction Toolkit: challenges and advances. - Marco Nolden; Sascha Zelzer; Alexander Seitel; Diana Wald; Michael Müller 001; Alfred M. Franz; Daniel Maleike; Markus Fangerau; Matthias Baumhauer; Lena Maier-Hein; Klaus H. Maier-Hein; Hans-Peter Meinzer; et al. (Int. J. Comput. Assist. Radiol. Surg., 2013)

Quality-centric modular software development in medical imaging research. - Marco Nolden (2013)

Entwicklung interaktiver Bildverarbeitungssysteme mit MITK und CTK. - Marco Nolden; Sascha Zelzer; Andreas Fetzer; Jasmin Metzger (Bildverarbeitung für die Medizin, 2014)

Challenges in Collecting Patient Characteristics for Analysis using Linked Data. - Benedikt Kämpgen; Keno März; Mohammadreza Hafezi; Alfred Adler; Patrick Philipp 002; Sascha Zelzer; Arash Saffari; Marco Nolden; Arianeb Mehrabi; Lena Maier-Hein; Achim Rettinger (CURAC, 2014)

Using Linked Data and Web APIs for Automating the Pre-processing of Medical Images. - Philipp Gemmeke; Maria Maleshkova; Patrick Philipp 002; Michael Götz; Christian Weber 001; Benedikt Kämpgen; Marco Nolden; Klaus H. Maier-Hein; Achim Rettinger (COLD, 2014)

MITK-US: real-time ultrasound support within MITK. - Keno März; Alfred Michael Franz; Alexander Seitel; A. Winterstein; Rolf Bendl; Sascha Zelzer; Marco Nolden; Hans-Peter Meinzer; Lena Maier-Hein (Int. J. Comput. Assist. Radiol. Surg., 2014)

Crowdgestützte Organsegmentierung: Möglichkeiten und Grenzen. - Eric Heim; Tobias Roß; Tobias Norajitra; Marco Nolden; Keno März; Daniel Kondermann; Stefanie Speidel; Klaus H. Maier-Hein; Lena Maier-Hein (CURAC, 2015)

Toward knowledge-based liver surgery: holistic information processing for surgical decision support. - Keno März; Mohammadreza Hafezi; Tobias Weller; Arash Saffari; Marco Nolden; Nassim Fard; A. Majlesara; Sascha Zelzer; Maria Maleshkova; Mykola Volovyk; N. Gharabaghi; Martin Wagner 001; et al. (Int. J. Comput. Assist. Radiol. Surg., 2015)

Suggesting Optimal Delineation Planes for Interactive 3D Segmentation. - Andreas Fetzer; Nico Riecker; Jasmin Metzger; Caspar J. Goch; Hans-Peter Meinzer; Marco Nolden (Bildverarbeitung für die Medizin, 2016)

Cognitive tools pipeline for assistance of mitral valve surgery. - Nicolai Schoch; Patrick Philipp 002; Tobias Weller; Sandy Engelhardt; Mykola Volovyk; Andreas Fetzer; Marco Nolden; Raffaele De Simone; Ivo Wolf; Maria Maleshkova; Achim Rettinger; Rudi Studer; et al. (Image-Guided Procedures, 2016)

Toward cognitive pipelines of medical assistance algorithms. - Patrick Philipp 002; Maria Maleshkova; Darko Katic; Christian Weber 001; Michael Götz; Achim Rettinger; Stefanie Speidel; Benedikt Kämpgen; Marco Nolden; Anna-Laura Wekerle; Rüdiger Dillmann; Hannes Kenngott; et al. (Int. J. Comput. Assist. Radiol. Surg., 2016)

Tutorial: Medical Image Processing with MITK Introduction and new Developments. - Caspar J. Goch; Jasmin Metzger; Marco Nolden (Bildverarbeitung für die Medizin, 2017)

Abstract: Medical Research Data Management Using MITK and XNAT - Connecting Medical Image Software and Data Management Systems in a Research Context. - Caspar Jonas Goch; Jasmin Metzger; Marco Nolden (Bildverarbeitung für die Medizin, 2017)

Abstract: Detektion des tibiotalaren Gelenkspaltes in intraoperativen C-Bogen Projektionen. - Sarina Thomas; Marc Schnetzke; Jochen Franke; Sven Yves Vetter; Benedict Swartman; Paul Alfred Grützner; Hans-Peter Meinzer; Marco Nolden (Bildverarbeitung für die Medizin, 2017)

Upper ankle joint space detection on low contrast intraoperative fluoroscopic C-arm projections. - Sarina Thomas; Marc Schnetzke; Michael Brehler; Benedict Swartman; Sven Yves Vetter; Jochen Franke; Paul Alfred Grützner; Hans-Peter Meinzer; Marco Nolden (Image-Guided Procedures, 2017)

MITK-OpenIGTLink for combining open-source toolkits in real-time computer-assisted interventions. - Martin Klemm; Thomas Kirchner; Janek Gröhl; Dominique Cheray; Marco Nolden; Alexander Seitel; Harald Hoppe; Lena Maier-Hein; Alfred M. Franz (Int. J. Comput. Assist. Radiol. Surg., 2017)

What does it all mean? Capturing Semantics of Surgical Data and Algorithms with Ontologies. - Darko Katic; Maria Maleshkova; Sandy Engelhardt; Ivo Wolf; Keno März; Lena Maier-Hein; Marco Nolden; Martin Wagner 001; Hannes Kenngott; Beat Peter Müller-Stich; Rüdiger Dillmann; Stefanie Speidel (CoRR, 2017)

Automated Containerized Medical Image Processing Based on MITK and Python - A Modular System to Implement Medical Image Processing Pipelines and Visualize Meta Data. - Caspar J. Goch; Jasmin Metzger; Martin Hettich; André Klein; Tobias Norajitra; Michael Götz; Jens Petersen; Klaus H. Maier-Hein; Marco Nolden (Bildverarbeitung für die Medizin, 2018)

Abstract: Leveraging Open Source Software to Close Translational Gaps in Medical Image Computing. - Jens Petersen; Sabine Heiland; Martin Bendszus; Jürgen Debus; Marco Nolden; Caspar J. Goch; Klaus Hermann Maier-Hein (Bildverarbeitung für die Medizin, 2018)

Efficient Web-Based Review for Automatic Segmentation of Volumetric DICOM Images. - Tobias Stein; Jasmin Metzger; Jonas Scherer; Fabian Isensee; Tobias Norajitra; Jens Kleesiek; Klaus H. Maier-Hein; Marco Nolden (Bildverarbeitung für die Medizin, 2019)

MITK-ModelFit: A generic open-source framework for model fits and their exploration in medical imaging - design, implementation and application on the example of DCE-MRI. - Charlotte Debus; Ralf Floca; Michael Ingrisch; Ina Kompan; Klaus H. Maier-Hein; Amir Abdollahi; Marco Nolden (BMC Bioinform., 2019)

Computer-assisted intra-operative verification of surgical outcome for the treatment of syndesmotic injuries through contralateral side comparison. - Sarina Thomas; Fabian Isensee; Simon Kohl; Maxim Privalov; Nils Beisemann; Benedict Swartman; Holger Keil; Sven Yves Vetter; Jochen Franke; Paul Alfred Grützner; Lena Maier-Hein; Marco Nolden; et al. (Int. J. Comput. Assist. Radiol. Surg., 2019)

An open-source software platform for translational photoacoustic research and its application to motion-corrected blood oxygenation estimation. - Thomas Kirchner; Janek Gröhl; Franz Sattler; Moritz S. Bischoff; Angelika Laha; Marco Nolden; Lena Maier-Hein (CoRR, 2019)

Abstract: MITK-ModelFit. - Ina Kompan; Charlotte Debus; Michael Ingrisch; Klaus H. Maier-Hein; Amir Abdollahi; Marco Nolden; Ralf Floca (Bildverarbeitung für die Medizin, 2020)

Abstract: Joint Imaging Platform for Federated Clinical Data Analytics. - Jonas Scherer; Marco Nolden; Jens Kleesiek; Jasmin Metzger; Klaus Kades; Verena Schneider; Hanno Gao; Peter Neher; Ralf Floca; Heinz-Peter Schlemmer; Klaus H. Maier-Hein (Bildverarbeitung für die Medizin, 2021)

DICOM Whole Slide Imaging for Computational Pathology Research in Kaapana and the Joint Imaging Platform. - Maximilian Fischer; Philipp Schader; Rickmer Braren; Michael Götz; Alexander Muckenhuber; Wilko Weichert; Peter J. Schüffler; Jens Kleesiek; Jonas Scherer; Klaus Kades; Klaus H. Maier-Hein; Marco Nolden (Bildverarbeitung für die Medizin, 2022)

Efficient DICOM Image Tagging and Cohort Curation Within Kaapana. - Klaus Kades; Jonas Scherer; Jan Scholtyssek; Tobias Penzkofer; Marco Nolden; Klaus H. Maier-Hein (Bildverarbeitung für die Medizin, 2022)

Deep Learning on Lossily Compressed Pathology Images: Adverse Effects for ImageNet Pre-trained Models. - Maximilian Fischer; Peter Neher; Michael Götz; Shuhan Xiao; Silvia Dias Almeida; Peter J. Schüffler; Alexander Muckenhuber; Rickmer Braren; Jens Kleesiek; Marco Nolden; Klaus H. Maier-Hein (MOVI@MICCAI, 2022)

Precise Energy Consumption Measurements of Heterogeneous Artificial Intelligence Workloads. - René Caspart; Sebastian Ziegler; Arvid Weyrauch; Holger Obermaier; Simon Raffeiner; Leon Pascal Schuhmacher; Jan Scholtyssek; Darya Trofimova; Marco Nolden; Ines Reinartz; Fabian Isensee; Markus Götz; et al. (ISC Workshops, 2022)

Abstract: Deep-learning on Lossily Compressed Pathology Images - Adverse Effects for ImageNet Pre-trained Models. - Maximilian Fischer; Peter Neher; Michael Götz; Shuhan Xiao; Silvia Dias Almeida; Peter J. Schüffler; Alexander Muckenhuber; Rickmer Braren; Jens Kleesiek; Marco Nolden; Klaus H. Maier-Hein (Bildverarbeitung für die Medizin, 2023)

The HMC Information Portal for Enhanced Metadata Collaboration in the Helmholtz FAIR Data Space. - Lucas Kulla; Jens Bröder; Constanze Curdt; Markus Kubin; Helen Kollai; Christine Lemster; Marco Nolden; Kai Schmieder; Annika Strupp; Karl-Uwe Stucky; Emanuel Söding; Konstantin Pascal Walter; et al. (CoRDI, 2023)

cOOpD: Reformulating COPD Classification on Chest CT Scans as Anomaly Detection Using Contrastive Representations. - Silvia Dias Almeida; Carsten T. Lüth; Tobias Norajitra; Tassilo Wald; Marco Nolden; Paul F. Jäger; Claus Peter Heussel; Jürgen Biederer; Oliver Weinheimer; Klaus H. Maier-Hein (MICCAI (5), 2023)

RPTK: The Role of Feature Computation on Prediction Performance. - Jonas R. Bohn; Christian M. Heidt; Silvia Dias Almeida; Lisa Kausch; Michael Götz; Marco Nolden; Petros Christopoulos; Stephan Rheinheimer; Alan A. Peters; Oyunbileg von Stackelberg; Hans-Ulrich Kauczor; Klaus H. Maier-Hein; et al. (MTSAIL/LEAF/AI4Treat/MMMI/REMIA@MICCAI, 2023)

Enhanced Diagnostic Fidelity in Pathology Whole Slide Image Compression via Deep Learning. - Maximilian Fischer; Peter Neher; Peter J. Schüffler; Shuhan Xiao; Silvia Dias Almeida; Constantin Ulrich; Alexander Muckenhuber; Rickmer Braren; Michael Götz; Jens Kleesiek; Marco Nolden; Klaus H. Maier-Hein (MLMI@MICCAI (2), 2023)

Abstract: Reformulating COPD Classification on Chest CT Scans as Anomaly Detection using Contrastive Representations - cOOpD. - Silvia Dias Almeida; Carsten T. Lüth; Tobias Norajitra; Tassilo Wald; Marco Nolden; Paul F. Jäger; Claus Peter Heussel; Jürgen Biederer; Oliver Weinheimer; Klaus H. Maier-Hein (Bildverarbeitung für die Medizin, 2024)

Abstract: Radiomics Processing Toolkit - Role of Feature Computation on Prediction Performance. - Jonas R. Bohn; Christian M. Heidt; Silvia Dias Almeida; Lisa Kausch; Michael Götz; Marco Nolden; Petros Christopoulos; Stephan Rheinheimer; Alan A. Peters; Oyunbileg von Stackelberg; Hans-Ulrich Kauczor; Klaus H. Maier-Hein; et al. (Bildverarbeitung für die Medizin, 2024)

Abstract: Enhanced Diagnostic Fidelity in Pathology Whole Slide Image Compression via Deep Learning. - Maximilian Fischer; Peter Neher; Peter J. Schüffler; Shuhan Xiao; Silvia Dias Almeida; Constantin Ulrich; Alexander Muckenhuber; Rickmer Braren; Michael Götz; Jens Kleesiek; Marco Nolden; Klaus H. Maier-Hein (Bildverarbeitung für die Medizin, 2024)

Harmonized Import of Clinical Research Data for the Open Source Image Analysis Platform Kaapana. - Lucas Kulla; Philipp Schader; Klaus H. Maier-Hein; Marco Nolden (Bildverarbeitung für die Medizin, 2024)

Learned Image Compression for HE-Stained Histopathological Images via Stain Deconvolution. - Maximilian Fischer; Peter Neher; Tassilo Wald; Silvia Dias Almeida; Shuhan Xiao; Peter J. Schüffler; Rickmer Braren; Michael Götz; Alexander Muckenhuber; Jens Kleesiek; Marco Nolden; Klaus H. Maier-Hein (MOVI@MICCAI, 2024)

Evaluating Pretraining Strategies for OCT-Based Macular Degeneration Classification. - Jessica Kächele; Robin Peretzke; Alexandra Ertl; Maximilian Fischer; Marlin Hanstein; Florian M. Hauptmann; Dimitrios Bounias; Marco Nolden; Peter Neher; Klaus H. Maier-Hein (DIAMOND/MARIO@MICCAI, 2024)

Unlocking the Potential of Digital Pathology: Novel Baselines for Compression. - Maximilian Fischer; Peter Neher; Peter J. Schüffler; Sebastian Ziegler; Shuhan Xiao; Robin Peretzke; David A. Clunie; Constantin Ulrich; Michael Baumgartner 001; Alexander Muckenhuber; Silvia Dias Almeida; Michael Götz; et al. (CoRR, 2024)

Abstract: Learned Image Compression for HE-stained Histopathological Images via Stain Deconvolution. - Maximilian Fischer; Peter Neher; Tassilo Wald; Constantin Ulrich; Peter J. Schüffler; Shuhan Xiao; Silvia Dias Almeida; Alexander Muckenhuber; Rickmer Braren; Michael Götz; Jens Kleesiek; Marco Nolden; et al. (Bildverarbeitung für die Medizin, 2025)

Medical Image De-Identification Benchmark Challenge. - Linmin Pei; Sutton Granger; Michael W. Rutherford; Ulrike Wagner; Tracy S. Nolan; Kirk E. Smith; Phillip Farmer; Peter Gu; Ambar Rana; Kailing Chen; Thomas Ferleman; Brian Park; et al. (CoRR, 2025)