Tests of Automatic Annotation Using KOG Proteins and ESTs from 4 Eukariotic Organisms. - Maurício de Alvarenga Mudado; Estevam Bravo-Neto; José Miguel Ortega (BSB, 2005)

MamMiBase: a mitochondrial genome database for mammalian phylogenetic studies. - Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos; Ana Carolina R. Guimarães; Carlos Henrique M. Castelletti; Célia S. Caruso; Cristina Ribeiro 003; Fabiano Yokaichiya; Geraldo R. G. Armôa; Gislaine da Silva P. Pereira; Israel T. da Silva; Carlos G. Schrago; Adélia L. V. Fernandes; Aline R. da Silveira; et al. (Bioinform., 2005)

A set of amino acids found to occur more frequently in human and fly than in plant and yeast proteomes consists of non-essential amino acids. - Francisco Prosdocimi; Maurício de Alvarenga Mudado; José Miguel Ortega (Comput. Biol. Medicine, 2007)

Uso da base de dados decundária KOG como ferramenta para caracterização de expressão gênica e mineração de dados em projetos transcriptoma. - Maurício de Alvarenga Mudado (2007)

A system for recognition of biological patterns in toxins using computational intelligence. - Bernardo Penna Resende de Carvalho; Thais Melo Mendes; Ricardo de Souza Ribeiro; Ricardo Fortuna; José Marcos Veneroso; Maurício de Alvarenga Mudado (CIBCB, 2009)

Plant Co-expression Annotation Resource: a web server for identifying targets for genetically modified crop breeding pipelines. - Marcos José Andrade Viana; Adhemar Zerlotini; Maurício de Alvarenga Mudado (BMC Bioinform., 2021)