A String-Matching Algorithm for the CREW PRAM. - Nalvo F. de Almeida Jr.; Valmir Carneiro Barbosa (Inf. Process. Lett., 1993)

Phylogeny from Whole Genome Comparison. - Graziela S. Araújo; Nalvo F. de Almeida Jr. (WOB, 2002)

Comparison of Genomes Using High-Performance Parallel Computing. - Nalvo F. Almeida Jr.; Carlos E. R. Alves; Edson Cáceres; Siang W. Song (SBAC-PAD, 2003)

Determinação de regiões ortólogas múltiplas. - Nalvo F. de Almeida Jr.; Luciana Montera (WOB, 2003)

A method to determine homologous protein families based on graph cliques and profiles. - Nalvo F. de Almeida Jr.; João C. Setubal; Marcelo de Carvalho; Carlos Juliano M. Viana (WOB, 2004)

A Method for Comparing Three Genomes. - Guilherme P. Telles; Marcelo M. Brigido; Nalvo F. Almeida; Carlos Juliano M. Viana; Daniel A. S. Anjos; Maria Emília Telles Walter (BSB, 2005)

Mapping Contigs onto Reference Genomes. - Nalvo F. Almeida; André C. Lima; Said Sadique Adi; Carlos Juliano M. Viana; Marcel Y. Nakazaki; Andrey A. Tamura; Luciana Y. Hiratsuka; Leandro P. Brazil (BSB, 2007)

A Method for Inferring Biological Functions Using Homologous Genes Among Three Genomes. - Daniel A. S. Anjos; Gustavo G. Zerlotini; Guilherme A. Pinto; Maria Emília Telles Walter; Marcelo M. Brigido; Guilherme P. Telles; Carlos Juliano M. Viana; Nalvo F. Almeida (BSB, 2007)

kGC: Finding Groups of Homologous Genes across Multiple Genomes. - Guilherme P. Telles; Nalvo F. Almeida; Marcelo M. Brigido; Paulo Antonio Alvarez; Maria Emília Telles Walter (BSB, 2011)

Live Phylogeny. - Guilherme P. Telles; Nalvo F. Almeida; Rosane Minghim; Maria Emília M. T. Walter (J. Comput. Biol., 2013)

Efficient Parallel Implementations of Multiple Sequence Alignment using BSP/CGM Model. - Jucele Franca de Alencar Vasconcellos; Christiane Nishibe; Nalvo F. Almeida; Edson Norberto Cáceres (PMAM, 2014)

TCBB Special Section on the Brazilian Symposium on Bioinformatics 2013. - João C. Setubal; Nalvo F. Almeida (IEEE ACM Trans. Comput. Biol. Bioinform., 2015)

Distance-based Live Phylogeny. - Graziela S. Araújo; Guilherme P. Telles; Maria Emília M. T. Walter; Nalvo F. Almeida (BIOINFORMATICS, 2017)

A Branch and Bound for the Large Live Parsimony Problem. - Rogério Güths; Guilherme P. Telles; Maria Emília M. T. Walter; Nalvo F. Almeida (BIOINFORMATICS, 2017)

A Heuristic for the Live Parsimony Problem. - Rogério Güths; Guilherme P. Telles; Maria Emília M. T. Walter; Nalvo F. Almeida (BIOSTEC (Selected Papers), 2017)

A Genetic Algorithm for Character State Live Phylogeny. - Rafael L. Fernandes; Rogério Güths; Guilherme P. Telles; Nalvo F. Almeida; Maria Emília M. T. Walter (BSB, 2018)

TabPath: interactive tables for metabolic pathway analysis. - Lauro Ângelo Gonçalves de Moraes; Érica Barbosa Felestrino; Renata de Almeida Barbosa Assis; Diogo Matos; Joubert de Castro Lima; Leandro de Araújo Lima; Nalvo F. de Almeida Jr.; João Carlos Setubal; Camila Carrião Machado Garcia; Leandro Márcio Moreira (Bioinform., 2018)

Live neighbor-joining. - Guilherme P. Telles; Graziela S. Araújo; Maria Emília Telles Walter; Marcelo M. Brigido; Nalvo F. Almeida (BMC Bioinform., 2018)

A Classification of de Bruijn Graph Approaches for De Novo Fragment Assembly. - Elvismary Molina de Armas; Maristela Holanda; Daniel de Oliveira 001; Nalvo F. Almeida; Sérgio Lifschitz (BSB, 2020)

Extended Pairwise Sequence Alignment. - Eloi Araujo; Fábio Viduani Martinez; Luiz C. S. Rozante; Nalvo F. Almeida (ICCSA (1), 2023)