Compareads: comparing huge metagenomic experiments. - Nicolas Maillet; Claire Lemaitre; Rayan Chikhi; Dominique Lavenier; Pierre Peterlongo (BMC Bioinform., 2012)

Comparaison de novo de données de séquençage issues de très grands échantillons métagénomiques : application sur le projet Tara Oceans. (De novo comparision of huge metagenomic experiments coming from NGS technologies : application on Tara Oceans project). - Nicolas Maillet (2013)

Commet: Comparing and combining multiple metagenomic datasets. - Nicolas Maillet; Guillaume Collet; Thomas Vannier; Dominique Lavenier; Pierre Peterlongo (BIBM, 2014)