Building a Corpus for Biomedical Relation Extraction of Species Mentions. - Oumaima El Khettari; Solen Quiniou; Samuel Chaffron (BioNLP@ACL, 2023)

Annotation d'interactions hôte-microbiote dans des articles scientifiques par similarité sémantique avec une ontologie. - Oumaima El Khettari; Solen Quiniou; Samuel Chaffron (ARTS@CORIA-TALN, 2023)

Mention-Agnostic Information Extraction for Ontological Annotation of Biomedical Articles. - Oumaima El Khettari; Noriki Nishida; Shanshan Liu; Rumana Ferdous Munne; Yuki Yamagata; Solen Quiniou; Samuel Chaffron; Yuji Matsumoto 001 (BioNLP@ACL, 2024)

DrBenchmark: A Large Language Understanding Evaluation Benchmark for French Biomedical Domain. - Yanis Labrak; Adrien Bazoge; Oumaima El Khettari; Mickael Rouvier; Pacôme Constant dit Beaufils; Natalia Grabar; Béatrice Daille; Solen Quiniou; Emmanuel Morin; Pierre-Antoine Gourraud; Richard Dufour (LREC/COLING, 2024)

Summarization for Generative Relation Extraction in the Microbiome Domain. - Oumaima El Khettari; Solen Quiniou; Samuel Chaffron (CoRR, 2025)