Vermont: a multi-perspective visual interactive platform for mutational analysis. - Alexandre V. Fassio; Pedro M. Martins 001; Samuel da S. Guimarães; Sócrates S. A. Junior; Vagner S. Ribeiro; Raquel Cardoso de Melo Minardi; Sabrina de Azevedo Silveira (BMC Bioinform., 2017)

How to compute protein residue contacts more accurately? - Pedro M. Martins 001; Vinícius D. Mayrink; Sabrina de Azevedo Silveira; Carlos Henrique da Silveira; Leonardo H. F. de Lima; Raquel Cardoso de Melo Minardi (SAC, 2018)

Proteingo: Motivation, user experience, and learning of molecular interactions in biological complexes. - Marcos Felipe Martins Silva; Pedro M. Martins 001; Diego C. B. Mariano; Lucianna Helene Santos; Isabela Pastorini; Naiara Pantuza; Cristiane Neri Nobre; Raquel Cardoso de Melo Minardi (Entertain. Comput., 2019)

Propedia: a database for protein-peptide identification based on a hybrid clustering algorithm. - Pedro M. Martins 001; Lucianna Helene Santos; Diego C. B. Mariano; Felippe C. Queiroz; Luana L. Bastos; Isabela de Souza Gomes; Pedro H. C. Fischer; Rafael E. O. Rocha; Sabrina de Azevedo Silveira; Leonardo H. F. de Lima; Mariana T. Q. de Magalhães; Maria G. A. Oliveira; et al. (BMC Bioinform., 2021)

Protein structural bioinformatics: An overview. - Vinícius de Almeida Paiva; Isabela de Souza Gomes; Cleiton Rodrigues Monteiro; Murillo Ventura Mendonça; Pedro Magalhães Martins; Charles Abreu Santana; Valdete M. Gonçalves-Almeida; Sandro Carvalho Izidoro; Raquel Cardoso de Melo Minardi; Sabrina de Azevedo Silveira (Comput. Biol. Medicine, 2022)