Assessing the Nature of Lipid Raft Membranes. - Perttu S. Niemelä; Samuli Ollila; Marja T. Hyvönen; Mikko Karttunen; Ilpo Vattulainen (PLoS Comput. Biol., 2007)

Conformational Changes and Slow Dynamics through Microsecond Polarized Atomistic Molecular Simulation of an Integral Kv1.2 Ion Channel. - Pär Bjelkmar; Perttu S. Niemelä; Ilpo Vattulainen; Erik Lindahl (PLoS Comput. Biol., 2009)

Role of Lipids in Spheroidal High Density Lipoproteins. - Timo Vuorela; Andrea Catte; Perttu S. Niemelä; Anette Hall; Marja T. Hyvönen; Siewert J. Marrink; Mikko Karttunen; Ilpo Vattulainen (PLoS Comput. Biol., 2010)