q-gram based database searching using a suffix array (QUASAR). - Stefan Burkhardt; Andreas Crauser; Paolo Ferragina; Hans-Peter Lenhof; Eric Rivals; Martin Vingron (RECOMB, 1999)

Segmentierung des Knochens aus T1- und PD-gewichteten Kernspinbildern vom Kopf. - Stefan Burkhardt; Dietmar Saupe; Frithjof Kruggel; Carsten Wolters (Bildverarbeitung für die Medizin, 2001)

Korrektur von geometrischen Verzeichnungen bei MR-Aufnahmen vom Femur. - Stefan Burkhardt; Michael Roth 008; Achim Schweikard; Rainer Burgkart (Bildverarbeitung für die Medizin, 2002)

One-Gapped q-Gram Filtersfor Levenshtein Distance. - Stefan Burkhardt; Juha Kärkkäinen (CPM, 2002)

Filter algorithms for approximate string matching. - Stefan Burkhardt (2002)

Registrierung von präoperativen 3D-MRT-Daten mit intraoperativen 2D-Fluoroskopieaufnahmen zur Patientenlageerkennung. - Stefan Burkhardt; Michael Roth 008; Achim Schweikard; Rainer Burgkart (Bildverarbeitung für die Medizin, 2003)

Bestimmung der Gradientenstärken von MR-Sequenzen mit Hilfe von Kalibrierkörpern. - Stefan Burkhardt; Achim Schweikard; Rainer Burgkart (Bildverarbeitung für die Medizin, 2003)

A new system for completely MR-based computer-assisted orthopaedic surgery. - Stefan Burkhardt; Michael Roth 008; Achim Schweikard; Rainer Burgkart (CARS, 2003)

Fast Lightweight Suffix Array Construction and Checking. - Stefan Burkhardt; Juha Kärkkäinen (CPM, 2003)

Better Filtering with Gapped q-Grams. - Stefan Burkhardt; Juha Kärkkäinen (Fundam. Informaticae, 2003)

Numerical determination of the susceptibility caused geometric distortions in magnetic resonance imaging. - Stefan Burkhardt; Achim Schweikard; Rainer Burgkart (Medical Image Anal., 2003)

Local Approximate 3D Matching of Proteins in Viral Cryo-EM Density Maps. - Stefan Burkhardt; Kimmo Fredriksson; Tuomas Ojamies; Janne Ravantti; Esko Ukkonen (3DPVT, 2004)

Bdd-based analysis of gapped q-gram Filters. - Marc Fontaine; Stefan Burkhardt; Juha Kärkkäinen (Int. J. Found. Comput. Sci., 2005)

Linear work suffix array construction. - Juha Kärkkäinen; Peter Sanders 001; Stefan Burkhardt (J. ACM, 2006)