Alignment of Tandem Repeats with Excision, Duplication, Substitution and Indels (EDSI). - Michael Sammeth; Thomas Weniger; Dag Harmsen; Jens Stoye (WABI, 2005)

Ridom TraceEdit: a DNA trace editor and viewer. - Jörg Rothgänger; Markus Weniger; Thomas Weniger; Alexander Mellmann; Dag Harmsen (Bioinform., 2006)

MIRU-VNTRplus: datenbankgestützte polyphasische Analyse von Mycobacterium-tuberculosis-complex-Genotypisierungsdaten. - Thomas Weniger (2008)

MIRU-VNTRplus: a web tool for polyphasic genotyping of Mycobacterium tuberculosis complex bacteria. - Thomas Weniger; Justina Krawczyk; Philip Supply; Stefan Niemann; Dag Harmsen (Nucleic Acids Res., 2010)